Не понял сути проблемы...
Но решение могу предложить
Если я правильно понимаю, то вопрос заключается в том,чтобы сохранять все чертежи в одном файле?? Если проблема в этом, то можно работать на разных слоях. Создаете темплейт с двумя форматками на слоях(например 201 и 202 - горизонтальная и вертикальная, кстати, кому надо, есть почти гостовские А4 и А3(если не ошибаюсь), могу выложить). И дальше раскидываете все по слоям, соответственно.
Честно говоря, никогда не проверял, но сработать должно))
Проблема тут может возникнуть в автоматическом заполнении штампа. И немножко с печатью.
А ассоциативность - так если поддерживается драфтом, то куда она денется??? Главное отслеживать связи, а виды брать из окончательной сборки(, либо из тех, что в сборе не дорабатывались,короче нужно самому не запутаться
)
зы: слои можно прокомментировать названием листов сборки или типа того.