У меня была однажды похожая проблемка. Во время работы в Базисе одновременно был запущен рендер, если не изменяет память, или работала другая какая то ресурсоемкая программа и Базис притормаживал до такой степени, что появлялись такие же проблемы, как Вы описываете...
Возможно это связано с последними обновлениями Майкрософт с
заплаткой для ядра Intel.. Других предположений у меня пока нет..